MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 chromosome

Total Repeats: 92347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018748	A	6	6	73	78	100 %	0 %	0 %	0 %	408671770
2	NC_018748	GAT	2	6	158	163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671770
3	NC_018748	A	6	6	234	239	100 %	0 %	0 %	0 %	408671770
4	NC_018748	GAG	2	6	282	287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408671770
5	NC_018748	CTA	2	6	300	305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671770
6	NC_018748	TTG	2	6	358	363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671770
7	NC_018748	CCT	2	6	414	419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408671770
8	NC_018748	CTC	2	6	427	432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408671770
9	NC_018748	TGC	2	6	581	586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671770
10	NC_018748	CTT	2	6	619	624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671770
11	NC_018748	TCA	2	6	735	740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671770
12	NC_018748	TCA	2	6	760	765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671770
13	NC_018748	ATA	2	6	778	783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671770
14	NC_018748	ATT	2	6	828	833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671770
15	NC_018748	GAT	2	6	834	839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671770
16	NC_018748	GAAAA	2	10	856	865	80 %	0 %	20 %	0 %	408671770
17	NC_018748	A	6	6	862	867	100 %	0 %	0 %	0 %	408671770
18	NC_018748	TTC	2	6	879	884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671770
19	NC_018748	TCA	2	6	902	907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671770
20	NC_018748	GA	3	6	947	952	50 %	0 %	50 %	0 %	408671770
21	NC_018748	AGA	2	6	965	970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671770
22	NC_018748	A	6	6	1053	1058	100 %	0 %	0 %	0 %	408671770
23	NC_018748	CA	3	6	1108	1113	50 %	0 %	0 %	50 %	408671770
24	NC_018748	ACGT	2	8	1126	1133	25 %	25 %	25 %	25 %	408671770
25	NC_018748	ATT	2	6	1157	1162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671770
26	NC_018748	ATT	2	6	1266	1271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671770
27	NC_018748	CCG	2	6	1303	1308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408671770
28	NC_018748	ATT	2	6	1511	1516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671770
29	NC_018748	ATA	2	6	1532	1537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671770
30	NC_018748	AAACC	2	10	1610	1619	60 %	0 %	0 %	40 %	408671771
31	NC_018748	AAAT	2	8	1644	1651	75 %	25 %	0 %	0 %	408671771
32	NC_018748	GAT	2	6	1679	1684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671771
33	NC_018748	ATG	2	6	1726	1731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671771
34	NC_018748	ACT	2	6	1756	1761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671771
35	NC_018748	TAAA	2	8	1778	1785	75 %	25 %	0 %	0 %	408671771
36	NC_018748	TGG	2	6	1881	1886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408671771
37	NC_018748	AAT	2	6	1893	1898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671771
38	NC_018748	CAT	2	6	1901	1906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671771
39	NC_018748	TCA	2	6	1934	1939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671771
40	NC_018748	TTC	2	6	2017	2022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671771
41	NC_018748	TGAA	2	8	2034	2041	50 %	25 %	25 %	0 %	408671771
42	NC_018748	CTTT	2	8	2108	2115	0 %	75 %	0 %	25 %	408671771
43	NC_018748	A	6	6	2164	2169	100 %	0 %	0 %	0 %	408671771
44	NC_018748	T	6	6	2174	2179	0 %	100 %	0 %	0 %	408671771
45	NC_018748	CAAT	2	8	2191	2198	50 %	25 %	0 %	25 %	408671771
46	NC_018748	ATTC	2	8	2267	2274	25 %	50 %	0 %	25 %	408671771
47	NC_018748	AAT	2	6	2332	2337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671771
48	NC_018748	TTTC	2	8	2351	2358	0 %	75 %	0 %	25 %	408671771
49	NC_018748	TGC	2	6	2361	2366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671771
50	NC_018748	T	6	6	2372	2377	0 %	100 %	0 %	0 %	408671771
51	NC_018748	ACC	2	6	2416	2421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408671771
52	NC_018748	TCC	2	6	2505	2510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408671771
53	NC_018748	T	6	6	2554	2559	0 %	100 %	0 %	0 %	408671771
54	NC_018748	TTC	2	6	2568	2573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671771
55	NC_018748	A	6	6	2597	2602	100 %	0 %	0 %	0 %	408671771
56	NC_018748	ATT	2	6	2649	2654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671771
57	NC_018748	A	6	6	2723	2728	100 %	0 %	0 %	0 %	408671771
58	NC_018748	CTT	2	6	3077	3082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671772
59	NC_018748	AGA	2	6	3090	3095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671772
60	NC_018748	A	7	7	3095	3101	100 %	0 %	0 %	0 %	408671772
61	NC_018748	AGA	2	6	3180	3185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671772
62	NC_018748	A	6	6	3367	3372	100 %	0 %	0 %	0 %	408671772
63	NC_018748	TGA	2	6	3402	3407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671772
64	NC_018748	A	6	6	3478	3483	100 %	0 %	0 %	0 %	408671772
65	NC_018748	GCA	2	6	3484	3489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408671772
66	NC_018748	CAC	2	6	3553	3558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408671772
67	NC_018748	GGAA	2	8	3609	3616	50 %	0 %	50 %	0 %	408671772
68	NC_018748	A	6	6	3749	3754	100 %	0 %	0 %	0 %	408671772
69	NC_018748	GAAA	2	8	3756	3763	75 %	0 %	25 %	0 %	408671772
70	NC_018748	GAAA	2	8	3771	3778	75 %	0 %	25 %	0 %	408671772
71	NC_018748	AACA	2	8	3779	3786	75 %	0 %	0 %	25 %	408671772
72	NC_018748	AGCCAA	2	12	3861	3872	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	408671772
73	NC_018748	ATATT	2	10	3882	3891	40 %	60 %	0 %	0 %	408671772
74	NC_018748	ATA	2	6	3911	3916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671772
75	NC_018748	TGC	2	6	3945	3950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671772
76	NC_018748	GAA	2	6	3957	3962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671772
77	NC_018748	CTT	2	6	4083	4088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671773
78	NC_018748	TAT	2	6	4128	4133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671773
79	NC_018748	GAA	2	6	4185	4190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671773
80	NC_018748	CTTA	2	8	4261	4268	25 %	50 %	0 %	25 %	408671773
81	NC_018748	A	6	6	4280	4285	100 %	0 %	0 %	0 %	408671773
82	NC_018748	TTTTA	2	10	4352	4361	20 %	80 %	0 %	0 %	408671773
83	NC_018748	GAA	2	6	4377	4382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671773
84	NC_018748	CAAG	2	8	4391	4398	50 %	0 %	25 %	25 %	408671773
85	NC_018748	CGA	2	6	4403	4408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408671773
86	NC_018748	ATT	2	6	4467	4472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671773
87	NC_018748	GAA	2	6	4488	4493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671773
88	NC_018748	AAG	2	6	4569	4574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671773
89	NC_018748	ATA	2	6	4592	4597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671773
90	NC_018748	A	9	9	4812	4820	100 %	0 %	0 %	0 %	408671774
91	NC_018748	GAA	2	6	4851	4856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671774
92	NC_018748	TGA	2	6	4865	4870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671774
93	NC_018748	T	6	6	4874	4879	0 %	100 %	0 %	0 %	408671774
94	NC_018748	AAG	2	6	4893	4898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671774
95	NC_018748	ATA	2	6	4939	4944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671774
96	NC_018748	CTTT	2	8	4992	4999	0 %	75 %	0 %	25 %	408671774
97	NC_018748	TGA	2	6	5033	5038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671774
98	NC_018748	GGAT	2	8	5072	5079	25 %	25 %	50 %	0 %	408671774
99	NC_018748	AAT	2	6	5102	5107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671774
100	NC_018748	GCA	2	6	5118	5123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408671774
101	NC_018748	TAT	2	6	5126	5131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671774
102	NC_018748	TAA	2	6	5134	5139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671774
103	NC_018748	TGG	2	6	5148	5153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408671774
104	NC_018748	TAT	2	6	5154	5159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671774
105	NC_018748	TAA	2	6	5257	5262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671774
106	NC_018748	TGA	2	6	5267	5272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671774
107	NC_018748	TCA	2	6	5277	5282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671774
108	NC_018748	GTA	2	6	5299	5304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671774
109	NC_018748	CTT	2	6	5366	5371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671774
110	NC_018748	A	6	6	5381	5386	100 %	0 %	0 %	0 %	408671774
111	NC_018748	T	7	7	5399	5405	0 %	100 %	0 %	0 %	408671774
112	NC_018748	A	6	6	5466	5471	100 %	0 %	0 %	0 %	408671774
113	NC_018748	TGA	2	6	5525	5530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671774
114	NC_018748	TAAA	2	8	5533	5540	75 %	25 %	0 %	0 %	408671774
115	NC_018748	GTG	2	6	5557	5562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408671774
116	NC_018748	A	6	6	5619	5624	100 %	0 %	0 %	0 %	408671774
117	NC_018748	AAT	2	6	5628	5633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671774
118	NC_018748	AAC	2	6	5653	5658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671774
119	NC_018748	GCT	2	6	5712	5717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671774
120	NC_018748	AT	3	6	5760	5765	50 %	50 %	0 %	0 %	408671774
121	NC_018748	GAA	2	6	5769	5774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671774
122	NC_018748	ATA	3	9	5886	5894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671774
123	NC_018748	AAACT	2	10	5912	5921	60 %	20 %	0 %	20 %	408671774
124	NC_018748	T	6	6	6111	6116	0 %	100 %	0 %	0 %	408671775
125	NC_018748	CCT	2	6	6158	6163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408671775
126	NC_018748	CTCA	2	8	6205	6212	25 %	25 %	0 %	50 %	408671775
127	NC_018748	AGT	2	6	6213	6218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671775
128	NC_018748	AAG	2	6	6223	6228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671775
129	NC_018748	GTTT	2	8	6314	6321	0 %	75 %	25 %	0 %	408671775
130	NC_018748	TAA	2	6	6440	6445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671775
131	NC_018748	ATT	2	6	6447	6452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671775
132	NC_018748	GAT	2	6	6621	6626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671775
133	NC_018748	AAG	2	6	6667	6672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671775
134	NC_018748	GAA	2	6	6711	6716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671775
135	NC_018748	TTC	2	6	6722	6727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671775
136	NC_018748	AGC	2	6	6759	6764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408671775
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258	NC_018748	AACC	2	8	13544	13551	50 %	0 %	0 %	50 %	408671780
259	NC_018748	TGTT	2	8	13557	13564	0 %	75 %	25 %	0 %	408671780
260	NC_018748	AAT	2	6	13566	13571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671780
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263	NC_018748	CAT	2	6	13673	13678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671780
264	NC_018748	TTA	2	6	13724	13729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671780
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